在选美比赛结束后，告别母亲花子就带着小霞一行三人准备离开蓝普尔其市，前往他们的的下一个目的地，不过最近的这片海域却不太平静。
“喂！你们看那是什么？”出声的是小刚，只见他眯着眼睛望去，“那好像是墨海马啊！”
小智三人闻言定睛一看，果然在这片海面上出现了一只身形娇小的墨海马。
不过仔细看的话就能发现这只墨海马的状态不太好，身上好像受了很严重的伤。
“真的是墨海马，好可爱！”小霞双眼变成了桃心。
“它似乎是受了伤。”小黄则比较仔细，墨海马的状况似乎不太好。
“你们看，它好像在说什么？”
这时候，墨海马竟然对着海面使用了墨汁，在墨海马的操作下形成了一幅巨大的画。
像是在警醒小智一行人，想要传递什么信息。
“那画面的样子应该是玛瑙水母。”
小智已经能看出这幅画的模样，大概就是毒刺水母，看来原着的巨大毒刺水母快到来了。
而另一方面，小霞已经派宝石海星将墨海马带了上来。
“是谁做了这么过分的事情啊，不可原谅！墨海马你放心，马上就给你疗伤！”小霞抱着墨海马心疼的说道。
小黄立马上前为墨海马治疗，不一会儿墨海马就在小黄常磐之力的作用下成功被治好了。
可是被治好的墨海马依然在向他们求救，像是在发出什么信号。
“这些水母真是一群可恶的家伙……”出现在小智等人的面前出现了一个有些令人讨厌的老太婆。
出现在他们眼前是之前的金婆婆，一个令人讨厌的老太婆。
“你竟然敢说它们令人讨厌？”小霞见这老太婆一直说玛瑙水母的坏话，不由得大怒。
“妨碍我赚钱都是废物，需要被我摧毁。我看你们都是训练家吧！帮我赶跑这些水母怎么样？成功的话，我给你们一千万奖金。”老太婆嚣张的说道。
小智想都没想就拒绝了，“这一都是你的贪婪心作祟，不然这些精灵怎么会破坏人类的家园。”
“我对不起它们？明明是它们给我捣乱啊！你们身为我的同胞，不肯帮忙就算了，还帮着这些捣乱的精灵说话。”
“既然你们不帮忙，自然有人肯帮！”老太婆愤怒的说道，同时广播里突然响起了召集训练家赶走玛瑙水母的悬赏。
原来他是想召集更多的训练家前来驱逐这些玛瑙水母。
而人性的弱点再一次显露无疑，如此巨额的奖金吸引了大量的训练家，让所有人趋之若鹜。
然后，最后这个工作竟然被阴魂不散的火箭队得到了。
甚至还发明出了国产三杯醋想要解决这群玛瑙水母。
“看我的喵！”
只见火箭队三人组直接将国产三杯醋倒入海中，这事情不仅没有办法得到解决，还催化出一只超级巨大的毒刺水母出来，让这件事情的事态变得更加严重了。
小智看着远方的庞然大物，虽然毒刺水母变大了，但实力仅仅是天王级别的程度，还在小智能解决的范畴。
“皮卡丘，这次要拜托你出手了。”
“皮卡皮~（就交给我吧！）”
皮卡丘拍拍自己的胸膛，表示这一切都包在他它身上。
经过了这么久，终于轮到它出手了。
“小智哥哥，这一切都不是精灵们的错。”小黄拉住小智的手，有些不忍心的看着这些玛瑙水母。
拥有常磐之力的她，能够深深地感受到这些精灵的心情，玛瑙水母们现在都被愤怒的怒火包围着。
一定是有人对它们做出了非常生气的事，所以它们才会变得那么愤怒。
“放心，我知道该怎么做。”他又怎么能不知道这件事情的前因后果，终究是人类心中的贪婪破坏了玛瑙水母们的最后的家园。
他仅仅是想要皮卡丘上巨大毒刺水母冷静下来，尽量让他不要伤害城里无辜的人。
而事实上也正是如此，皮卡丘不断的用它无与伦比的速度与巨大毒刺水母周旋。
同时不断用十万伏特让这只毒刺水母冷静下来。
可是愤怒的毒刺水母硬扛着皮卡丘的伤害，依然对这座城市进行大肆破坏。
看来对方已经愤怒到了极点，现在只想让这些人类尝尝苦头，体会一下家园被破坏的滋味。
最终，毒刺水母带着玛瑙水母群涌进了城市，众人终于知道了事情的原委。
毒刺水母通过控制喵喵说话让人明白了事情的原委，如果不是人类大肆破坏它们居住的珊瑚礁，它们也不会奋起反击。
“墨海马想要告诉们我们的是这件事，我竟然没有办法了解它的意思，身为水系的神奇宝贝训练家，我真是太失责了。”小霞自责的说道，然后一个人跑了出去。
对着水系神奇宝贝有着不一般喜爱的小霞走到毒刺水母面前。
“住手啊！毒刺水母，求求你快带大家回到海里去吧！”小霞不顾危险爬上了一座高楼，在楼顶对毒刺水母喊道。
而皮卡丘则是跟在小霞的身边，保护她的安危。
“毒刺水母，请你回去吧！你们的意思人类已经知道了，我们再也不会破坏你们住的地方了，毒刺水母，求求你，求求你们回去吧。”
“下一次不会这么简单就了事了。”毒刺水母瞥了一眼小霞，巨大的毒刺水母指挥着玛瑙水母开始后撤。
毕竟经此破坏，人类也已经得到了惨痛的教训。
“可恶的毒刺水母.…”结果这个时候，那个不知死活的老太婆竟然冲上来聒噪。
但是被皮卡丘的十万伏特给电晕了过去，不给她任何开口的机会。
这件事情的最后，小智以精灵博士的身份和大木博士一起上报给了联盟，要求他们处理这件事。
而这件事也确实留下了非常不好的影响，再加上小智和大木博士的联合施压，联盟也是派出了一位四天王来处理这件事。
经过重重调查，发现了银婆婆这个罪魁祸首，还有她的姐姐金婆婆也不是良善，两人犯罪的罪行铁证如山。
最后，金银婆婆同时铛锒入狱，这件事情也就此告一段落。
而小智一行人也早就继续踏上了他们的旅行。
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